گزارش دیوان محاسبات بهوضوح دلایل عدم تحقق کامل منابع هدفمندی را مشخص میکند. مهمترین عامل این مشکل، عدم واریز کامل منابع وصولی توسط شرکتهای تابعه وزارت نفت به حسابهای هدفمندی یارانههاست،
همچنین عدم شفافیت در فرآیند فروش و وصول این منابع توسط شرکتهای مذکور یکی دیگر از دلایل عمده کمبود منابع هدفمندی بهشمار میرود.